Три объекта культурного наследия федерального значения в Марий Эл обзавелись не только границами территории, но и охранными зонами. Постановления Правительства Марий Эл касаются Стрелецкой часовни в Козьмодемьянске, Дома Пчелиных в Йошкар-Оле и церкви Ежово-Мироносицкого монастыря.
Охранная зона Стрелецкой часовни в Козьмодемьянске, кроме самой часовни, датируемой 1696-1697 гг., включает в себя три объекта культурного наследия регионального значения: бывшие купеческие дома (конец XVIII – первая четверть XIX вв.), составлявшие усадьбу Бычкова (ул. Совесткая, 7), а также административное здание с орнаментальной резьбой 1911 г. постройки (ул. Советская, 18). Зона регулирования застройки и хозяйственной деятельности, выделенная внутри границ объекта культурного наследия, включает в себя ещё несколько объектов: два бывших купеческих, а ныне административных здания (ул. Советская, 3 , 5) и торговые ряды на ул. Лихачёва.
Федеральный Закон об объектах культурного наследия народов Российской Федерации определяет зону регулирования застройки и хозяйственной деятельности как территорию, на которой ограничены строительство и хозяйственная деятельность, а также определены требования к реконструкции существующих зданий и сооружений. Всего же в охранной зоне Стрелецкой часовни располагается 21 объект культурного наследия (это особо ценные и просто ценные, а также обычные объекты культурного наследия). Одно сооружение внутри охранной зоны является дисгармоничным.
Охранная зона йошкар-олинского дома Пчелиных почти совпадает с границами улиц Чехова, Вознесенской, Красноармейской и Набережной и включает в себя все, расположенные в этом квартале здания и строения Йошкар-Олинской епархии.
Из 7 объектов культурного наследия, расположенных на близлежащих территориях, в охранной зоне расположены три: дом Пчелиных (он построен в XVIII веке), Вознесенская церковь (1756 г. постройки), а также дом Пчелиной (1916 г. постройки – объект культурного наследия регионального значения) на ул. Набережной, 28. В охранную зону объекта культурного наследия федерального значения, таким образом, не вошли ни дом Чулкова (ул. Карла Маркса, 39 ), ни ещё один дом Пчелиной (ул. Крсноармейская, 6), ни жилой дом, расположенный по адресу: ул. Карла Маркса, 37. Все они, тем не менее, сохраняют за собой статус объектов культурного наследия регионального значения.
Зона регулирования застройки и хозяйственной деятельности, отсутствующая в Йошкар-Оле – самая заметная часть охранной зоны церкви Ежово-Мироносицкого монастыря. Граница охранной зоны церкви совпадает с периметром монастырской стены, а вот регулировать застройку и хозяйственную деятельность «посада» предполагается в пределах двух дальних улиц села Ежово.